- Δ.Ε. Ηρακλείου
- 1η Δημοτική κοινότητα (κεντρική)
- 2η Δημοτική κοινότητα (Ανατολική)
- 3η Δημοτική κοινότητα (Δυτική)
- Τοπική κοινότητα Βουτών
- Τοπική κοινότητα Δαφνών
- Τοπική κοινότητα Σταυρακίων
- 4η Δημοτική κοινότητα (Νότια)
- Τοπική κοινότητα Σκαλανίου
- Δημοτική κοινότητα Βασιλειών
- Δ.Ε. Ν. Αλικαρνασσού
- Δημοτική κοινότητα Νέας Αλικαρνασσού
- Τοπική κοινότητα Καλλιθέας
- Δ.Ε. Γοργολαΐνι
- Τοπική κοινότητα Αγ. Μύρωνα
- Τοπική κοινότητα Άνω Ασιτών
- Τοπική κοινότητα Κάτω Ασιτών
- Τοπική κοινότητα Πενταμοδίου
- Τοπική κοινότητα Πετροκεφάλου
- Τοπική κοινότητα Πυργούς
- Δ.Ε. Τεμένους
- Τοπική κοινότητα Προφήτη Ηλία
- Τοπική κοινότητα Αγίου Σύλλα
- Τοπική κοινότητα Κυπαρίσσου
- Δ.Ε. Παλλιανής
- Τοπική κοινότητα Αυγενικής
- Τοπική κοινότητα Βενεράτου
- Τοπική κοινότητα Κερασίων
- Τοπική κοινότητα Σίβα